In 1546 werd opgericht de stad Arica in een plaats genaamd El Chinchorro. In vijftig jaar dat de stad werd verwoest door de aardbeving en tsunami, die gedwongen de bewoners te bewegen hun huizen in de haven onder de bescherming van de Kaap Morro, in de plaats waar hij nu is.

Het huidige gebouw Arica de Kathedraal werd gebouwd op de ruïnes van de tweede tempel van de stad, gebouwd in 1640. Na 200 jaar van dienst in deze Kerk werd ook verwoest door een aardbeving in 1868. Bewaard gebleven alleen de stenen trap op. Het project van een nieuwe Kerk gebouw werd in opdracht van de Peruaanse President josé Balta in het franse atelier van Gustave Eiffel en was oorspronkelijk gericht op het resort Ancona. Maar in 1875 werd besloten tot de bouw in Arica. Binnen een jaar, hield de Kerk zijn eerste Mis.

Tijdens de Pacific-oorlog (1879-1883) Arica was eigendom van Chili. Maar tot in de twintigste eeuw, met de komst van Arica bleef onder de leiding van het bisdom van Arequipa, volgens het decreet van het Vaticaan. In 1910 werd de burgemeester van de stad Arica, MAXIMO Lire, vaardigde een decreet van de uitzetting van een Peruaanse priester en zijn assistent van het land. Ze werden vervangen door de Chileense militaire kapelaans.

In 1911 werd de Kerk gehecht aan het bisdom van Tarapaca (nu het bisdom van Iquique). En in 1959 werd overgebracht naar de rang van Kathedraal. Met de zegen van Paus Johannes Paulus II in 1986 werd opgericht bisdom van Arica met het centrum in de Kathedraal van St. Mark in Arica.

De Kerk is relatief klein, in de Gotische stijl. Het ontwerp van de Kerk is geheel gemaakt van metalen balken, kolommen verbonden door spitsbogen, met uitzondering van twee houten deuren. De tempel toren stijgt op naar de hemel, waardoor de bouw van de schoonheid en de grootheid die wordt versterkt door het landschap: de Plaza de colón, Cape Morro de Arica Harbor, port en grenzeloze zee.

In 1984 stond het gebouw werd uitgeroepen tot een Nationaal monument van Chili. En in 2002 - een Historisch monument van de ariki.