Een andere attractie van Cordoba Kerk van San Francisco, die behoort tot de zogenaamde "ferdinandova ' kerken', genoemd vanwege het feit dat zij als een van de eerste Christelijke kerken gebouwd in Cordoba na de herovering op de Moren door koning Ferdinand III. Zodra de Kerk deel gebouwd in de 13e eeuw het klooster van San Pedro El real. Het klooster, behorende tot de Franciscaanse religieuze gemeenschappen, vrij groot was voor zijn tijd en had een grote invloed in het religieuze leven van de stad. Het is bekend dat er in de 17de eeuw leefde honderd monniken, en de grootste van de welvaart en invloed in de 18e eeuw. Maar in het begin van de 19de eeuw en tijdens het begin van de Napoleontische oorlogen werd het klooster verwoest, de San Francisco Kerk op wonderbaarlijke wijze overleefd.

Oorspronkelijk gemaakt in de Gotische stijl, het is vandaag de bouw van de Kerk van San Francisco, op slechts gedeeltelijk lijkt op de originele structuur. Tijdens de 18e eeuw werd het gebouw gerestaureerd meerdere malen in de gevel zijn er tal van elementen in de Barokke stijl die zijn aanzienlijk veranderd de middeleeuwse uitstraling van de Kerk.

Vandaag, de Kerk van San Francisco is niet alleen één van de oudste, maar ook één van de rijkste gemeenten van Cordoba. Hier herbergt vele culturele waarden verzameld sinds de middeleeuwen. Er is ook een interessante collectie schilderijen van Córdoba een kunstenaar van de 18e eeuw. Speciale aandacht verdient en antieke meubelen, gevestigd in de gebouwen van de tempel.