De Kerk van San Francesco in Gaeta werd gesticht door de volgelingen van St. Franciscus van Assisi in 1222, het jaar. De bouw gulle donaties ondersteund koning Karel II van Anjou-dynastie, die trouw was aan de voorschriften van St. Francis. Grote Gotische Kerk werd in de 14e eeuw voltooid. Het bestaat uit een middenschip met hoge plafonds, twee lagere zijbeuken, een plein pastorie en de apsis aan het einde. Net als veel andere kerken Gaeta, San Francesco was versierd met kunstwerken tussen de 16e en 18e eeuw. Binnen begraven sommige leden van de adellijke families van de stad en de leden van de spaanse regering.

Na de invasie van het grondgebied van het Schiereiland van Napoleon, die besloten tot de ontbinding van alle religieuze orden en de sluiting van kerken en kloosters, de Kerk van San Francesco begon te dalen. Zelfs na de restauratie uitgevoerd van 1854 door 1858-ste jaar onder leiding van architect Guarinello, de Kerk al enige tijd verlaten. Het is vermeldenswaard dat de restauratie van San Francesco werd gehouden onder het beschermheerschap van de italiaanse Koninklijke familie, en het werd bijgewoond door dezelfde vakmensen die werkte op de Kerk van San Francesco di Paola in Napels.

Kleine schade aan het gebouw van de Kerk leed in de turbulente 1860-er jaren, toen was het proces van de eenwording van Italië, en tijdens de Tweede wereldoorlog San Francesco geleden veel meer zeer. Na restauratie werd uitgevoerd in 1951-52-m jaar.

Om naar de tempel van de trap op het bovendek die is omsloten door een hek, is een monument en die een prachtig uitzicht biedt op Gaeta en de Baai. In het midden van de gevel is een groot portal met marmeren beelden aan de zijkanten van Charles II van Napels en Ferdinand II. Op het timpaan toont een allegorie van de restauratie van het pausdom, en van links naar rechts zijn er de beelden van St. Bernard, Ambrosius, Franciscus, Augustinus en Thomas van Aquino. Binnen in de Kerk zijn een groot gipsen beelden van de Apostelen, en op de top van de kerk, van Christus de Verlosser. De decoratie van San Francesco dient als de belangrijkste altaar, ontworpen door Guarinello, en een aantal schilderijen met afbeeldingen van heiligen en bijbelse taferelen.

Links van de Kerk staat een gebouw wat ooit een klooster. Het behouden van het klooster van de 14e eeuw. Een grote binnenplaats geserveerd als een site voor recreatie, die was zelfs een voetbal veld.