Volgens de legende, de naam "midden op de berg" stamt af van een aantal medew Munehisa Misuri, die leefde in de eerste helft van de 16e eeuw en die stond bekend om zijn liefdadigheidswerk in relatie tot God ' s kerken. Gerespecteerde lokale historicus Okulich-Kazarin N. W. koos voor de meest plausibele versie van de oorsprong van de naam van de Kerk van klein moerassen, met de naam van Maria, omdat deze moerassen eenmaal in de oudheid en werd omringd door een berg.

De bouw van een stenen Kerk opgetreden in 1547. Oorspronkelijk was de Kerk monastieke. In de registers van de schrijver het boek 1623 noemt man'nikovo klooster neem dan contact op met de bergen. Het is over dit klooster is geschreven in het Leven van mineah russische Metropolitan Macarius. Er is een veronderstelling dat de Abt Kotelnikova klooster, in de 60-jaren van de 16e eeuw was de Basilicum-Barlaam, wie is de auteur van het leven van Alexander Nevski, de euphrosynus van Pskov.

In 1808 was de Kerk bestemd voor de sloop als een zeer oude, maar nog steeds de Heilige Synode niet toestemming te geven voor deze actie. In 1882, een koopman uit Pskov Stepnowski Petr Michailovitsj voordeur was een stenen bijgebouw. Tijdens 1892-1896, werd uitgevoerd reparatie en restauratie van de fondsen van de Kerk warden – Kafelnikov Ivan Michailovitsj – ereburger van de stad Pskov. De Kerk heeft twee altaren, één daarvan is de troon van de Evangelist en Apostel Johannes de theoloog, en de tweede naam ter ere van de Heilige Martelaar Johannes de Krijger. Tijdens 1786-1808, werd de Kerk toegewezen aan de tempel met George van de Heuvel, en in 1934 werd hij schreef de Kerk van de Heiligen, gelijk aan de apostelen Keizer Constantijn en zijn moeder Helena.

De toren werd gebouwd tegelijkertijd met de bouw van de Kerk van St. Johannes de Doper. De klok werd gehangen met zes klokken. In de parochie waren er drie kapellen, gebouwd van hout: de Wonderworker en St. Nicholas, in de buurt van het dorp van Krastanova, de Heilige Martelaar Anastasia en de Eerbiedwaardige Martelaar Anastasia.

In de Kerk van St. Johannes de Doper bestond hospice, parochie voogdij, het ziekenhuis, maar een parochiale school is nooit gebouwd. Aan het einde van de 19e eeuw in een dorp genaamd Geit Brod werd gebouwd, een Kerk parochie van de school, maar al snel in 1895 vanwege de nabijheid van andere stedelijke scholen gesloten.

Rond de omtrek van de hele Kerk, begraafplaats, waar begraven historicus en onderzoeker van Tzvelev S. A., restaurator Smirnov V. P., alsmede de soldaten die stierven tijdens de uitvoering van zijn militaire plicht.

Sinds 1913, de tempel priester Kolobov Fedor. In 1927, nadat hij was gearresteerd meerdere malen, Fedor Vasiljevitsj werd verbannen naar de Oeral. Vrouw Kolobov volgde hem, en na dat alle informatie die niet is gemeld. De Koster was een diaken Michail Lebedev, maar uit zijn latere leven, is niets bekend.

23 December 1936, is besloten om de Kerk, maar volgens andere bronnen, de diensten worden voortgezet tot de grote Patriottische oorlog. Tijdens de oorlog wordt de Kerk had ontvangen, wat schade aan muren, daken, interieur en exterieur afwerking. Tijdens 1970-1989, onder leiding van architect Lebedev V. A. was een complete restauratie van de Kerk. 3 Maart 1965 kerkhof was gesloten voor begrafenissen.

De eerste dienst begon in 1992 bij de ingang van de tempel. De revival van de Kerk van St. Johannes de Doper is nauw verweven met de naam van de beroemde Abt van Iona. Heeft bijgedragen aan de restauratie van de Kerk en de Directeur van de Pskov kabel plant Kukushkin Viktor Petrovitsj.
In 2001 Pskov Aartsbisschop Eusebius uitgevoerd, de rite van heiliging van acht klokken, die werd geworpen in de stad Voronezh, volgens de oude manier. Vandaag in de Kerk is er een zondag-school en verricht de bedevaart service, die kreeg de status van een diocesane.