Volgens de geschriften van Yaroslavl historici van Athanasius klooster werd gesticht na 1612, in een tijd waarin in de buurt van de Kerk van Athanasius en Cyril in de kapel is de vinding van het miraculeuze icoon van de Verlosser. Maar er is bewijs dat het klooster bestond al in de 16e eeuw In 1615 Gavriil Makushkin, district superintendent, gericht aan de Metropolitan van Rostov Cyril om een zegen over de Stichting van het klooster aan de heilige plaats.

Er is bewijs dat Athanasius klooster werd geregeerd door abten. In de eerste jaren van haar bestaan heeft het al ontvangen mandaat en bevoegdheden volgens de charters van Michail Fedorovich. In de eerste brief, gedateerd 1619 werd gezegd dat Athanasius klooster vrijgesteld van Ruga geld en voedsel, kaarsen, wijn, wierook. Ook het klooster is een plaats toegewezen onder de molen op de Romanov en de Yaroslavl kant. Met het bos en het hout, dat het klooster was de uitoefening van de Wolga, de Mologa en Sheksna naar het klooster leven plicht wordt niet geheven. Het klooster ook werden bevrijd van de post van Gouverneur, de boyars, prinsen en militaire mensen.

De eerste gebouwen van hout waren, in de 17e eeuw het klooster werd herhaaldelijk verwoest in de brand. Dus, in 1658, het klooster werd volledig verwoest. De eerste steen van de Kerk van het klooster ter ere van Athanasius en Cyril werd gebouwd in 1664 met de zegen van de metropoliet van Rostov Jona Sysoyevich. Na voltooiing van de Kerk was versierd met schilderijen gemaakt door de Moskou masters. In het vuur van 1670 het klooster weer geleden. In 1676 aan de Kathedraal van het Noorden werd gebouwd winter Kerk met een klokkentoren, die werd ingewijd ter ere van de Grootstedelijke Alexis van Moskou. In 1736 op verzoek van de Abt van het klooster van Iona, en door een decreet van de Aartsbisschop Joachim aan Afanasievsky klooster toegeschreven aan de kapel verbonden aan het bord of de tentoonstelling hal van de toren, die de toegangspoort tot de Aarden stad. Vandaag de dag is het bekend als Znamenskaya Kerk.

Athanasius belangrijke klooster was nooit in de rijkdom van hun bezittingen, of het aantal monniken: in 1717, waren er slechts zeven monniken dus een belets; personeel niet is toegenomen en volgens 1802 werd het klooster vrij klein, maar was beperkt tot de lage stenen muur net ten Oosten en Noord-Oosten. Andere partijen als het hek was van het klooster van de bijgebouwen Filistijn huizen, evenals de Redder Probinsya Kerk.

In het Oosten, de voorgevel van het klooster, die had een Uitsplitsing op straat, in de 18e eeuw, gebouwd op twee stenen torens van klein formaat, één van hen speelde de rol van de Heilige poorten, de andere was een kapel ter ere van een belangrijke gebeurtenis − de ontdekking van de wonderdoende icoon. Torens moesten de spitsen met cijfers van trompetterende engelen.

25 juni 1768 in het centrum van Yaroslavl in de gewone tijd de brand. In de lijst van de schade is opgenomen, in feite, de eerste beschrijving van de gebouwen van het klooster van Athanasius. Wanneer de restauratie werd bijgewerkt schilderij van de Kerk van Athanasius en Cyril, de originele stenen altaar werd vervangen met hout.

In 1820-1830 in het klooster werden uitgevoerd op grote schaal werken aan de verbetering: werden gebouwd, twee verdiepingen tellend stenen Abt kamers en eetzaal; zaten twee zuster-cellen; voor de Kerk van Athanasius en Cyril in 1825 handelaar Constantijn van Dienst geproduceerd op eigen kosten een nieuwe iconostase, Alexander Chrysikou van Yaroslavl verguld; in 1831, warme Kerk was versierd met schilderijen, muurschilderingen Timothy Medvedev. Op hetzelfde moment werd het herbouwd single-tiered klokkentoren boven de portiek warm de Kerk, van het opgeheven klooster van STS parochie werd overgebracht naar 115-pond bell. Het ensemble van het klooster klokkentoren werd zeven klokken.

Een ander herschikking van Athanasius het klooster werd vernietigd en aan het begin van 19-20 eeuw: in 1897 werden gerangschikt in een stenen kelder, een coach schuur, bad, stabiel; in 1903 en 1907. reparatie werk werd uitgevoerd in de Kathedraal, met financiering van F. E. Vakhrameev; in 1912, werd gerenoveerd, muurschildering van kunstenaar en restaurateur M. I. Dikarev op donaties A. En vahromeeva.

In 1764 door het decreet van Keizerin Catharina II Afanasyevsk het klooster werd als onbelangrijk. 12 December 1857 Afanasyevskaya het klooster verheven tot de derde klasse mate, de abten hadden het dit keer met een waardigheid van Archimandrite. Sinds 1895 Athanasius klooster kreeg de status van de woonplaats van een vicaris-Bisschop van het bisdom van Yaroslavl.

Na de revolutie, toen Athanasius klooster was gevestigd parochie gemeenschap. In februari 1925 het klooster werd gesloten, een deel van haar eigendom was overgedragen aan de Kerk van de Verlosser op de Stad en de andere tempels. In de jaren 1930, door het besluit van de gemeente, de klokkentoren werd gesloopt, en de Kerk van Athanasius en Cyril, en andere monastieke gebouwen en huisvesting van de organisatie, van productie workshops, broederlijke gebouw werd gebruikt voor de huisvesting.

In November 2007, de tempel met een muur en torens van de Heilige poorten gaf de russisch-Orthodoxe Kerk. Wanneer de Yaroslavl theological Seminary verplaatst naar het landgoed vahromeeva in opdracht van zijne Eminentie Kirill klooster Kerk werd een Seminarie. 31 januari 2008 in de kapel van Alexius werd gepleegd eerste service.