Museum van de Andes heiligdommen werd opgericht in 1996, na een belangrijk archeologisch onderzoek project "Heiligdommen hoogte Sur Andino", geleid door Dr. Johan Reinhard en Jose Antonio Chavez. Het Museum is bevroren "de mummie Juanita" en andere onderwerpen van de Inca-cultuur.

De studies uitgevoerd door de Katholieke Universiteit van Santa Maria voor vier decennia in de omgeving van Arequipa, heeft geleid tot vele archeologische artefacten, die nu tentoongesteld in de zeven zalen van het Museum. De wereld beroemde mummie Juanita, het meisje in het ijs" met haar bruidsschat is een van de meest bekende tentoonstellingen van het Museum, dat gezien kan worden van 1 mei tot en met 31 December van elk jaar. De resterende vier maanden van Juanita is in volledige duisternis, voor het beste behoud van het bevroren lichaam van een meisje (haar lichaam niet is onderworpen aan het proces van mummificatie). Juanita, ook wel bekend als Lady Ampato, gevonden werd in 1995 op de hellingen van de vulkaan Ampato op een hoogte van 5800 meter boven de zeespiegel. Radiocarbon studie Juanita bleek dat ze 530 jaar, het exacte tijdstip van de begrafenis – 1466 ad.

Bezoekers kunnen ook zien de tentoongestelde voorwerpen gemaakt van hout, metaal, textiel, goud en aardewerk die gebruikt werden in de ceremonies van de Inca Capac Koch, Viracocha, alsmede goud en keramiek beeldjes, goed bewaard gebleven dekens.

Momenteel research centre UCSM aan de Katholieke Universiteit van Santa maría de Arequipa heeft 6 speciale vriezer met een temperatuur van 26°C onder nul, en de twee speciale tentoonstelling cabine met behoud van dergelijke temperaturen en controle van de computer van de operator. Ook in het Museum geïnstalleerd airconditioning voor het behoud van archeologische materialen.